A Biblioteca providencia sessões de  formação de utilizadores, parte integrante de um projeto de Literacia da Informação que tem como objectivo proporcionar aos utilizadores as competências e as ferramentas necessárias para a sua auto-suficiência na utilização da informação.

O programa de formação da Biblioteca subdivide-se em: Formação Inicial e Formação Avançada.

Formação Inicial é destinada aos alunos do 1º ano e ocorre invariavelmente no início do ano letivo nas primeiras semanas de Outubro. Desenrola-se em sessões com cerca de 1/2 hora de duração, cujo intuito é dar a conhecer os espaços, serviços e recursos disponibilizados pela Biblioteca NMS|FCM, local e remotamente.

Formação a pedido é destinada a todos os membros da NMS|FCM e pretende promover a otimização dos recursos eletrónicos disponibilizados a toda a comunidade. Decorre em sessões de 1 hora sobre: como pesquisar a PubMed, como pesquisar o Access Medicine e saber como usar o software de gestão de citações EndNote - sujeita a marcação quer a título individual, quer pelo corpo docente para turmas/grupos de alunos com conteúdos seleccionados.